３月１８日のダイヤ改正により常磐線上野〜土浦の中距離区間はグリーン車を連結しているＥ５３１系に統一するため、同区間を走る４１５系鋼製車と 共にＥ５０１系が上野口運用から撤退し、ダイヤ改正以後は常磐線の土浦以北と水戸線にて運用されてます。